电影的主线事件，是万磁王企图用特殊机器将参加联合国峰会的高层人物都转化为变种人，因为机器对使用者损伤极大，故而万磁王抓来能吸取变种人能力的小淘气，代替自己。而影片的叙事，将此事拆解埋伏，化入多人的故事线，做出了一定的悬疑效果。
开场的两个序幕，分别是二战时童年万磁王在集中营的悲惨遭遇，和小淘气青春期差点致死男友的噩梦，也都是两人能力觉醒的时刻，其实就暗示了两者将产生的联系。正片伊始，因为变种人注册案的议会上人类政客的强硬敌对表态，万磁王下定决心行动，派人寻找小淘气。小淘气那厢惶恐离家出走，偶遇金刚狼，狼叔这才不迟也不早地登场。小淘气搭了狼叔的便车，途中被万磁王手下袭击，被X战警救走，这才让主人公卷入了主线事件中。剧本利用狼叔，制造了一个小小的障眼法。因为X战警惊讶于狼叔的自愈能力，金属骨骼，加上主角身份，带着观众以为万磁王要找的是金刚狼。直到狼叔和万磁王在车站正面遭遇，方知小淘气才是目标。另一边魔形女抓来的人类议员被机器强行变异后逃离，与X战警的接触，展示了机器的致命性，以及本片的危机高潮，这才揭开了抓走小淘气的目的。
作为一部商业片，《X战警》剧本几乎可以当作范本。起承转合，主线危机，多线分支，人物交流与变化，伏笔放置与回收，一分钟营救，一个不少，有条不紊。世界观建设，感情戏，动作戏，价值观碰撞，内容浅尝即止，却也相当丰满。
