TMD的发展可划分为三个阶段，即功能障碍阶段、结构障碍阶段和关节器质性损伤阶段，分别对应疾病的早期、中期和晚期。虽然病程可能会持续几年甚至几十年，且疾病会反复发作，但它具有自我限制的特点，一般不会导致关节强直，预后通常良好。其临床表现以三个主要特征最为突出：
下颌运动异常是TMD的典型症状之一。患者常常会出现开口异常，表现为开口过大或过小，开口时偏斜或扭曲，甚至在开闭运动中会出现关节绞锁。正常情况下，成人自然开口度平均约为100px，开口型不偏，呈现正常的“↓”形态。
疼痛是TMD患者常常感受到的另一个症状。疼痛主要出现在开口和咀嚼时，部位通常在关节区或关节周围的肌肉群。通常情况下，患者不会自发地感到疼痛。对于长期不愈、病程迁延的患者，他们可能会感到关节区沉重、酸肿胀，咀嚼肌疲劳，以及脸颊、颞区、枕区的慢性疼痛和感觉异常。
弹声和杂音也是TMD的重要表现之一。正常的下颌运动过程中，关节通常不会发出明显的弹性和噪音。在TMD患者中，常见的异常声音包括弹性声音，即开口运动时的“咔、咔”声；破碎音，即开口时的“咔叭、咔叭”破碎声；以及摩擦声，即在开口时像玻璃纸一样的连续摩擦声。
除了上述特征症状外，TMD还可能伴随着多种其他症状，如耳症、眼症、吞咽困难、言语困难以及慢性全身疲劳等。这些症状可能会给患者带来诸多不便，影响生活质量。及早发现、诊断和治疗TMD至关重要。
